Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufm1P61961 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufm1P61961 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms