Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arf3P61205 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arf3P61205 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms