Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paxbp1P58501 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms