Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Strn4P58404 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms