Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CckbrP56481 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckbrP56481 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms