Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf5P56477 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf5P56477 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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