Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsc2P55292 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsc2P55292 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms