Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab8aP55258 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab8aP55258 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms