Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PctpP53808 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PctpP53808 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PctpP53808 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PctpP53808 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PctpP53808 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PctpP53808 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PctpP53808 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PctpP53808 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms