Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LtbrP50284 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LtbrP50284 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms