Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkn1cP49919 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkn1cP49919 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn1cP49919 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn1cP49919 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn1cP49919 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn1cP49919 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn1cP49919 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkn1cP49919 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms