Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms