Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt1P46096 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt1P46096 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Syt1P46096 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt1P46096 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt1P46096 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt1P46096 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syt1P46096 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syt1P46096 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt1P46096 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt1P46096 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Syt1P46096 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt1P46096 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt1P46096 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syt1P46096 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms