Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TtlP38585 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TtlP38585 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TtlP38585 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtlP38585 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TtlP38585 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtlP38585 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtlP38585 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TtlP38585 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtlP38585 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtlP38585 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtlP38585 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtlP38585 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtlP38585 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TtlP38585 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TtlP38585 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtlP38585 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtlP38585 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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