Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PpargP37238 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PpargP37238 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PpargP37238 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PpargP37238 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PpargP37238 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpargP37238 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpargP37238 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpargP37238 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpargP37238 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms