Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TpoP35419 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TpoP35419 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TpoP35419 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TpoP35419 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TpoP35419 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TpoP35419 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TpoP35419 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TpoP35419 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TpoP35419 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms