Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa3P35173 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms