Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptk2P34152 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptk2P34152 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms