Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc1P29341 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms