Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa3P28310 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa3P28310 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa3P28310 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms