Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa2P28309 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms