Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpbP27790 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms