Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfaP20033 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfaP20033 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms