Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18529 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18529 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18529 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18529 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18529 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18529 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18529 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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P18529 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18529 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18529 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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P18529 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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P18529 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18529 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18529 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18529 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18529 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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P18529 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18529 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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P18529 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18529 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18529 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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P18529 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18529 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18529 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18529 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18529 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18529 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18529 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18529 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18529 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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P18529 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P18529 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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