Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rag1P15919 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rag1P15919 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rag1P15919 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms