Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb1P14733 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb1P14733 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms