Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scd1P13516 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scd1P13516 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd1P13516 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms