Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr4a1P12813 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms