Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrm1P12657 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms