Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd4P10628 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd4P10628 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms