Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TtrP07309 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtrP07309 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtrP07309 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TtrP07309 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TtrP07309 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TtrP07309 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TtrP07309 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TtrP07309 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TtrP07309 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TtrP07309 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtrP07309 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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