Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apoa4P06728 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa4P06728 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms