Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtnd1P03888 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms