Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01735 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01735 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01735 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01735 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01735 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01735 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01735 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01735 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01735 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01735 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01735 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01735 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01735 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01735 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01735 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms