Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casp8O89110 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms