Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lin7bO88951 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms