Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
F11rO88792 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
F11rO88792 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
F11rO88792 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
F11rO88792 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
F11rO88792 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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