Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap1O55125 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms