Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk1O54908 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk1O54908 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms