Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DffbO54788 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DffbO54788 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DffbO54788 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DffbO54788 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DffbO54788 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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