Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1dO35473 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1dO35473 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1dO35473 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1dO35473 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1dO35473 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1dO35473 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1dO35473 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C1dO35473 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1dO35473 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C1dO35473 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1dO35473 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1dO35473 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1dO35473 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1dO35473 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms