Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf5O35445 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf5O35445 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf5O35445 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf5O35445 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf5O35445 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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