Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-ObO35424 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-ObO35424 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms