Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Nedd9O35177 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd9O35177 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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