Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Kcnk3O35111 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Kcnk3O35111 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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