Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ascl4M0QW46 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl4M0QW46 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms