Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm379J3QQ19 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm379J3QQ19 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms