Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm21887J3QQ04 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms