Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2035J3QP87 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm2035J3QP87 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms