Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21976J3QNN2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21976J3QNN2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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